More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0810 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0810  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
223 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2898  peptidase M22 glycoprotease  38.1 
 
 
244 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  35.02 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  34.56 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  35.06 
 
 
250 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  32.46 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  35.68 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  31.17 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  34.56 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  28.63 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  37.44 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  27.47 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  34.91 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  32.58 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  31.49 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  28.57 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  33.18 
 
 
261 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.19 
 
 
781 aa  78.2  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  28.51 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  33.18 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  40.44 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1493  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0479198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  29.78 
 
 
239 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  35 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  35.29 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4569  peptidase M22, glycoprotease  42.03 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  33.18 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  36.28 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  38.76 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  32.9 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  29.57 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  38.4 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  33.63 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  33.95 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  36.62 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  36.62 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  30.04 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  38.62 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2716  peptidase M22 glycoprotease  28.26 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  38.97 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.74 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  36.62 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  36.62 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  36.62 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  33.86 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2748  peptidase M22 glycoprotease  33.18 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  28.95 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  36.78 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  39.69 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  39.69 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  34.52 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  37.4 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  33.18 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  39.69 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  39.69 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  31.79 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  27.31 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  31.84 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  36.52 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  32.77 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  38.17 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  36.09 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  34.07 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  27.93 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  30.6 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  28.27 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  27.51 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  35.16 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  29.91 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  30.96 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  35.88 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  30.18 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  36.31 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  34.05 
 
 
287 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  35.88 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  37.04 
 
 
234 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  30.36 
 
 
254 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  23.79 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  35.88 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  35.88 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1778  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  27.93 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  35.88 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  38.58 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  38.58 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  35.88 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  35.88 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  36.03 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  28.51 
 
 
234 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  35.88 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  26.97 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  36.62 
 
 
233 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  38.76 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.66 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  30.13 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>