More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0804 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  100 
 
 		 365 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  42.23 
 
 		 364 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  46.61 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  43.36 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  41.19 
 
 		 392 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.7 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  38.21 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  38.21 
 
 		 373 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  38.21 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.73 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  44.47 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  40.72 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  39.84 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  39.84 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.75 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  39.3 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  39.57 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  39.3 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.63 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  39.3 
 
 		 391 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  39.3 
 
 		 391 aa  245  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  39.02 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  39.02 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  39.73 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.53 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  44.41 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  35.73 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.81 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  38.44 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  46.58 
 
 		 811 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  37.3 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.87 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.46 
 
 		 371 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  39.3 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  39.4 
 
 		 441 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  37.67 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  37.4 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  39.83 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  42.3 
 
 		 388 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.8 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  42.58 
 
 		 851 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  39.84 
 
 		 375 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  41.4 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  50.95 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.66 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  39.62 
 
 		 395 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  36.76 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.11 
 
 		 403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  35.62 
 
 		 374 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  36.94 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  39.01 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  41.69 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  39.28 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  39.24 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  39.55 
 
 		 389 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  38.32 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  43.92 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  38.8 
 
 		 370 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.28 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  43.48 
 
 		 376 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  45.63 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  40 
 
 		 434 aa  219  3.9999999999999997e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  39 
 
 		 389 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  41.3 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.59 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.04 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  39.52 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  43.13 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.64 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  38.92 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  35.15 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  40.69 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40.86 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  35.33 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2736  alanine racemase  35.26 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.390221  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  40.59 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  41.01 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  44.63 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  48.47 
 
 		 844 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.08 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  41.36 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  39.52 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.08 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  34.33 
 
 		 382 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  34.33 
 
 		 382 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  37.84 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1888  alanine racemase  44.83 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  42.3 
 
 		 380 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  33.88 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.14 
 
 		 380 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  38.81 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  37.95 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  38.62 
 
 		 411 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  45.96 
 
 		 849 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>