More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0785 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  100 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  43.53 
 
 		 178 aa  126  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  36.79 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.6 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  47.45 
 
 		 178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  41.44 
 
 		 225 aa  117  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  40.96 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  38.75 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  36.76 
 
 		 223 aa  115  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  42.13 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  37.91 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.84 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  41.67 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  37.57 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  43.71 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  39.87 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.16 
 
 		 190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  35.96 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  38.78 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  37.99 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  43.05 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  38.96 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  43.06 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.09 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  33.16 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  42.96 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.04 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  32.82 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  40.97 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  43.18 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.42 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  39.66 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.66 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.29 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  42.86 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  39.66 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1643  GrpE protein  36.31 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3094  heat shock protein GrpE  37.85 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000190441  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  39.08 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  36.94 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  40.67 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  36.47 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  36.87 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.26 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  35.11 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  32.97 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.77 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  38.12 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  37.04 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.19 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  38.26 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  40.51 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  32.42 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  41.98 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  40.4 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  37.75 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  35.84 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.81 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36.26 
 
 		 208 aa  98.2  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  38.35 
 
 		 186 aa  98.2  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.1 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  40 
 
 		 189 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  36.31 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.4 
 
 		 192 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  35.42 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>