More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0697 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  100 
 
 		 340 aa  676    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.61 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.6 
 
 		 348 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.09 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.17 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.14 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.89 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.16 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  49.73 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.8 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  44.03 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.15 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.6 
 
 		 296 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.01 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  38.18 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.62 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2718  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.62 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.26 
 
 		 260 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.76 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.17 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.17 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  43.04 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  40.59 
 
 		 608 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  42.29 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.9 
 
 		 605 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.51 
 
 		 587 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  46 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.25 
 
 		 656 aa  165  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0820  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.71 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.84 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.74 
 
 		 299 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.21 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.21 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.09 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.17 
 
 		 605 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.17 
 
 		 605 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.44 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  43.88 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.54 
 
 		 329 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1937  signal peptide peptidase A  34.49 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.003866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.16 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.11 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  47.92 
 
 		 595 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.06 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.55 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.7 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.17 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  42.58 
 
 		 569 aa  153  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.98 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.41 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.87 
 
 		 269 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  37.84 
 
 		 609 aa  152  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0542  signal peptide peptidase A  35.88 
 
 		 394 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.99836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  41.95 
 
 		 269 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.09 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  41.46 
 
 		 269 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  40.89 
 
 		 269 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  43.14 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.74 
 
 		 589 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  38.36 
 
 		 611 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  41.63 
 
 		 616 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  43.75 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  40.85 
 
 		 609 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  45.14 
 
 		 595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.31 
 
 		 296 aa  146  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.69 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  37.89 
 
 		 616 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40 
 
 		 585 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  40.98 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  41.83 
 
 		 623 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.07 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.66 
 
 		 595 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  40.8 
 
 		 617 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.03 
 
 		 640 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.07 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  40.79 
 
 		 555 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.59 
 
 		 272 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  36.18 
 
 		 618 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  36.58 
 
 		 269 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.23 
 
 		 383 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  38.68 
 
 		 633 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  35.66 
 
 		 621 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.53 
 
 		 617 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.01 
 
 		 604 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.58 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  38.72 
 
 		 616 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  29.68 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.18 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  36.82 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.67 
 
 		 566 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.77 
 
 		 831 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.89 
 
 		 633 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.58 
 
 		 629 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.38 
 
 		 637 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  33.6 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  36.79 
 
 		 616 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.53 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.46 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.36 
 
 		 617 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  36.33 
 
 		 583 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>