More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0660 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 		 138 aa  286  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  65.87 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  68.46 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  62.31 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  63.57 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  67.97 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  69.42 
 
 		 161 aa  185  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 148 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  63.2 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 177 aa  180  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 		 185 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  60.63 
 
 		 134 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  64.84 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  61.6 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  62.9 
 
 		 137 aa  173  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  62.2 
 
 		 159 aa  173  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  62.02 
 
 		 156 aa  173  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  59.54 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  61.65 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  60.63 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  57.66 
 
 		 139 aa  171  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  66.4 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 183 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  62.2 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  59.85 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  59.85 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  61.6 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  60 
 
 		 132 aa  166  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  62.7 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  62.9 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  60.15 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  62.1 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  60.98 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  63.41 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  60.32 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 180 aa  163  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  59.52 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 158 aa  161  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  60.48 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  57.48 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  58.59 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  60.98 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  57.48 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  54.2 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 134 aa  157  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  61.79 
 
 		 212 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  58.96 
 
 		 140 aa  156  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 159 aa  156  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  52.67 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  57.94 
 
 		 135 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  59.35 
 
 		 353 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  60.63 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  55.91 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  54.76 
 
 		 506 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 		 136 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 		 135 aa  154  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  57.48 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  54.48 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  53.03 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  54.48 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  55.81 
 
 		 136 aa  153  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  58.73 
 
 		 131 aa  154  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 189 aa  153  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  58.82 
 
 		 140 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  55.91 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  53.73 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  55.12 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  53.73 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  53.73 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  53.12 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  56.59 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>