182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0655 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  100 
 
 		 270 aa  509  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  66.67 
 
 		 271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  66.18 
 
 		 271 aa  349  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  67.18 
 
 		 271 aa  342  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  66.3 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  61.92 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  61.92 
 
 		 269 aa  315  6e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  65.79 
 
 		 270 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  62.59 
 
 		 273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  63.08 
 
 		 269 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  63.12 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  58.46 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  63.85 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  57.69 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  61.42 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  55.56 
 
 		 271 aa  292  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  66.92 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  52.08 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  53.12 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  55.04 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  49.02 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  46.86 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  50.19 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  42.42 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  45.86 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  44 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  44.18 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  38.97 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  44.7 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  44.7 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  39 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  43.25 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  43.25 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  36.8 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  44.48 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  39.76 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  43.07 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  40.15 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  42.21 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  41.51 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  40.94 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  43.2 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  39.93 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  40 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  36.4 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  41.67 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  41.89 
 
 		 312 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  41.89 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  43.38 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  41.89 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  37.6 
 
 		 259 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  42.22 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  40.91 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  37.32 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  40.66 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  38.11 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  39.55 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  39.63 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  37.41 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  38.76 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  40.91 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  37.12 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  37.12 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  35.02 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  35.76 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  33.86 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  39.3 
 
 		 297 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  38.4 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.04 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  33.46 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  39.77 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  33.61 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  31.25 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  28.15 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.67 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  32.18 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  31.4 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  31.7 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  40.1 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  33.46 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  31.6 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  33.33 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  31.62 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  32.09 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  28.72 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  36.81 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  32.28 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  30.24 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  31.76 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  31.52 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  30.62 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.89 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  30.28 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  30.93 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  32.5 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  30.8 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4410  zinc/iron permease  32.91 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  30.65 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  29.15 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  30.24 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>