More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0601 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 
361 aa  703  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  64.33 
 
 
376 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  50.17 
 
 
338 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  48.44 
 
 
365 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.59 
 
 
347 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  49.82 
 
 
372 aa  244  1e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  39.58 
 
 
459 aa  235  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  43.05 
 
 
459 aa  234  2e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  41.87 
 
 
396 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  44.84 
 
 
513 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.58 
 
 
474 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.27 
 
 
474 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.72 
 
 
398 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.54 
 
 
478 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  39.26 
 
 
449 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.51 
 
 
453 aa  227  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.15082e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  38.2 
 
 
450 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.91 
 
 
398 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  38.2 
 
 
450 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  5.15523e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  42.76 
 
 
449 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  38.2 
 
 
450 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  38.2 
 
 
450 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  45.49 
 
 
393 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  38.2 
 
 
451 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  43.06 
 
 
469 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  41.59 
 
 
511 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  3.07319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  41.89 
 
 
508 aa  222  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  41.03 
 
 
389 aa  222  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  41.64 
 
 
389 aa  222  1e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  35.62 
 
 
467 aa  221  1e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  36.71 
 
 
407 aa  221  1e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  43.16 
 
 
398 aa  221  2e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  42.32 
 
 
368 aa  219  4e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.81204e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  37.14 
 
 
451 aa  219  4e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.46 
 
 
404 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  36.36 
 
 
407 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  37.14 
 
 
450 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  42.05 
 
 
401 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.05 
 
 
401 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  37.14 
 
 
450 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.80809e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  43.75 
 
 
446 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.05 
 
 
401 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.16 
 
 
452 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  37.14 
 
 
450 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  42.91 
 
 
456 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  43.98 
 
 
412 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  43.11 
 
 
404 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  44.01 
 
 
413 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  39.44 
 
 
473 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  42.76 
 
 
403 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  37.7 
 
 
479 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.4 
 
 
401 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  41.7 
 
 
402 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  36.6 
 
 
450 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.79 
 
 
401 aa  217  3e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  35.79 
 
 
401 aa  217  3e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  41.44 
 
 
453 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  37.17 
 
 
492 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.46 
 
 
408 aa  216  6e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  35 
 
 
403 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 
477 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  43.75 
 
 
477 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  42.07 
 
 
450 aa  215  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  35.79 
 
 
402 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  42.41 
 
 
450 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  37.17 
 
 
477 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.38 
 
 
450 aa  215  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.11786e-07  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41.97 
 
 
484 aa  215  1e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  42.65 
 
 
464 aa  214  1e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  35.79 
 
 
402 aa  214  1e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.17 
 
 
474 aa  214  1e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.81 
 
 
500 aa  215  1e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  39.57 
 
 
391 aa  215  1e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  35.79 
 
 
402 aa  214  2e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  35.79 
 
 
402 aa  214  2e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  35.79 
 
 
402 aa  214  2e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  37.47 
 
 
477 aa  213  3e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  40 
 
 
479 aa  213  4e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  43.11 
 
 
462 aa  213  4e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  41.34 
 
 
388 aa  213  4e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.7 
 
 
479 aa  213  5e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.34 
 
 
396 aa  212  6e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  41.7 
 
 
387 aa  213  6e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.79 
 
 
456 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.01293e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.03 
 
 
614 aa  212  8e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  43.34 
 
 
498 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.3 
 
 
379 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44.96 
 
 
460 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.43 
 
 
412 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  38.81 
 
 
474 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.7 
 
 
481 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  44.86 
 
 
395 aa  210  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  42.07 
 
 
489 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.4 
 
 
478 aa  210  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  38.03 
 
 
467 aa  209  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.9 
 
 
475 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  39.44 
 
 
468 aa  209  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  40.99 
 
 
388 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  40.62 
 
 
491 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  38.18 
 
 
471 aa  209  8e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>