More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0564 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
330 aa  677    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  54.63 
 
 
340 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  42.95 
 
 
288 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  39.45 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  38.63 
 
 
284 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
324 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
298 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 
330 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  38.7 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
342 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
344 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  35.25 
 
 
342 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
303 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  31.03 
 
 
311 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
305 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
334 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
279 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  32.84 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  32.34 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
455 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
722 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 
489 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.42 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
291 aa  112  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
286 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
300 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
327 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
1267 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.35 
 
 
838 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  24.85 
 
 
307 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
318 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
841 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 
324 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
324 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
1267 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
305 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
330 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
337 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
1523 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
293 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
624 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  32.73 
 
 
754 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
836 aa  93.2  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
616 aa  92.8  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
345 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
822 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
1523 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
350 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
310 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.4 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.91 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
970 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
334 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
705 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
1340 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
679 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 
1162 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>