51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0540 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
268 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  33.58 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 
263 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 
283 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
279 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
269 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.4 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.62 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  25.51 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  26.96 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  25.91 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  33.57 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  24.31 
 
 
299 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 
198 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  34.38 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  31.73 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 
324 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
205 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  24 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.01 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  23.31 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  26.5 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  40.79 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
210 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  32.11 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  23.87 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  22.71 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 
422 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  25.53 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  43.75 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  21.46 
 
 
269 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>