More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0539 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.31 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.42 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.29 
 
 		 238 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  34.55 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  36.07 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.73 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  33.19 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  33.49 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  38.05 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.15 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  35.29 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.5 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  38.5 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  29.46 
 
 		 379 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  31.13 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  30.77 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  32.29 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  30.34 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  30.34 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  30.34 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.09 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  30.34 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  33.05 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  32.55 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.66 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.59 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  31.13 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  31.13 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.5 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  31.13 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  32.39 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.06 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.7 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.8 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4982  GntR domain protein  33.17 
 
 		 229 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  34.43 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 218 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  31.5 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  34.22 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.33 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.39 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  34.1 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.67 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  33.65 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  33.33 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 218 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.37 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  35.18 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.32 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  28.74 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5865  GntR domain-containing protein  32.69 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1647  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  32.56 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>