More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0491 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  100 
 
 
303 aa  577  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  46.23 
 
 
297 aa  225  5e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  47.26 
 
 
309 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  46.94 
 
 
304 aa  215  6e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  44.86 
 
 
298 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  45.55 
 
 
297 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  43.2 
 
 
314 aa  201  1e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  42.91 
 
 
300 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  43.56 
 
 
316 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  42.27 
 
 
293 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  36.86 
 
 
317 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  42.57 
 
 
298 aa  175  1e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  44.9 
 
 
297 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  42.16 
 
 
288 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  43.3 
 
 
287 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  37.41 
 
 
321 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  37.41 
 
 
309 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  39.25 
 
 
320 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  43.6 
 
 
312 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  38.01 
 
 
304 aa  132  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  36.04 
 
 
317 aa  121  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  32.95 
 
 
328 aa  115  9e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  34.12 
 
 
305 aa  114  2e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  33.59 
 
 
330 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.89129e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.61 
 
 
331 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  28.86 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  28.86 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  33.94 
 
 
306 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  28.86 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.59 
 
 
307 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.59 
 
 
311 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  36.86 
 
 
315 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 
333 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  31.52 
 
 
337 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.72 
 
 
315 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  31.76 
 
 
331 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35.55 
 
 
320 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.43 
 
 
313 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.28 
 
 
319 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  34.02 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  31.25 
 
 
337 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31.31 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  28.26 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  31.56 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  28.08 
 
 
330 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.55 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.35 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  29.66 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  36.3 
 
 
305 aa  99  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  26.33 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  30.62 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  32.95 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  32.46 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  30.07 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.69 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  30.41 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 
330 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  30.79 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  30.41 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  32.09 
 
 
338 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  29.28 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  33.95 
 
 
407 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  30.65 
 
 
370 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.2 
 
 
320 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  35.63 
 
 
323 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.83 
 
 
360 aa  95.5  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  30.48 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  31.9 
 
 
331 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  24.18 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  34.6 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  29.94 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30.06 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  28.3 
 
 
330 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  31.68 
 
 
331 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  34.16 
 
 
296 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  30.48 
 
 
335 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  24.44 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.09 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  30.8 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4158  ribokinase  34.87 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0695289  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.17 
 
 
317 aa  92.4  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  33.46 
 
 
332 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  32.69 
 
 
645 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27.33 
 
 
320 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.18 
 
 
328 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.92808e-12  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  32.46 
 
 
308 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.66 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  24.16 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  27.21 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3692  PfkB domain protein  35.79 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  32.7 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  36.71 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.68 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  34.06 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  32.16 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.8 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.97 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  30.72 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  30.54 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>