More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0474 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  41.61 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  41.61 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  41.61 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  41.61 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  45 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  41.61 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  44.64 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 323 aa  231  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.44 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  41.52 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 299 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.58 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  41.02 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  40.2 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 295 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  42.69 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 298 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  41.24 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  41.24 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  41.24 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  39.23 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  41.24 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  39.93 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  41.44 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>