More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0469 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
474 aa  966    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  68.79 
 
 
430 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  69.88 
 
 
420 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 
423 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  69.3 
 
 
422 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 
427 aa  548  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 
412 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 
435 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  64.92 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
412 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
413 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 
445 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  63.3 
 
 
412 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  64.05 
 
 
430 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 
415 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  65.64 
 
 
442 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 
426 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 
429 aa  528  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  68.06 
 
 
447 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
422 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  65.02 
 
 
453 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
415 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 
432 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
432 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 
415 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 
435 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 
415 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
434 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 
415 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 
434 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
415 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 
412 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 
416 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  62.11 
 
 
425 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 
412 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 
412 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 
418 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 
452 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 
413 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
415 aa  498  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.66 
 
 
417 aa  501  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  63.27 
 
 
440 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 
421 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.15 
 
 
431 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 
413 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 
420 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
411 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 
412 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 
422 aa  490  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.14 
 
 
417 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 
434 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 
434 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 
434 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 
412 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 
415 aa  487  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 
429 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 
410 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 
414 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 
414 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
413 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 
417 aa  482  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 
434 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  58.46 
 
 
410 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 
424 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
413 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
417 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 
414 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
413 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
417 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 
414 aa  478  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
430 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 
413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
434 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 
432 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 
437 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.61 
 
 
422 aa  478  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 
413 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.43 
 
 
427 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 
417 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 
413 aa  477  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 
434 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 
417 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 
413 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 
417 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 
427 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 
417 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 
413 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.43 
 
 
427 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 
417 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 
417 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 
412 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 
431 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 
417 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>