135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0445 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  309  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  39.87 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  40.37 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  36.26 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  36.71 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  39.61 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  39.35 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  38.24 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  40.19 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  35.71 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  40.19 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  37.89 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  37.89 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  38.95 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  29.49 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  29.49 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  35.19 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  37.38 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  36.84 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  36.84 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  46.67 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  42.05 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  39.61 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  36.5 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  42.61 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  35.95 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  33.76 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  35.9 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  36.69 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  31.43 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  40 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  30.91 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  43.53 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  39.39 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  47.5 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  34.57 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  40.45 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  30.38 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  30.61 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  38.89 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  36.02 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  36.18 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  36.18 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  36.18 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  34.69 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  37.14 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  38.71 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  35.44 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  33.12 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.52 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  35.25 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  35.4 
 
 		 177 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  38.27 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  45.45 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  34.56 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  44.57 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  37.18 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  31.31 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  33.56 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  32.24 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  29.33 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  23.6 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  37.01 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  27.47 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  25.66 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  41.56 
 
 		 550 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  36.36 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  36.04 
 
 		 549 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  36.03 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  38.16 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  34.57 
 
 		 700 aa  50.4  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  36 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  31.21 
 
 		 522 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  34.58 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 		 575 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 493 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  43.1 
 
 		 646 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  39.53 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  39.73 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  34.72 
 
 		 512 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 486 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.77 
 
 		 673 aa  48.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  32.47 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>