More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0403 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0403  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 551 aa  1098    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000492986  n/a   
 
 
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.53 
 
 		 381 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.84 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.15 
 
 		 386 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  29.74 
 
 		 485 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  34.44 
 
 		 516 aa  94  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  30.16 
 
 		 525 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  28.53 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  31.36 
 
 		 469 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  30.45 
 
 		 411 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  33.9 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  28.27 
 
 		 375 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  29.41 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.24 
 
 		 426 aa  90.9  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  27.73 
 
 		 395 aa  90.9  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  27.46 
 
 		 483 aa  90.5  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 674 aa  90.1  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2439  hypothetical protein  34.81 
 
 		 381 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.33 
 
 		 382 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  32.41 
 
 		 375 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  26.99 
 
 		 471 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  29.87 
 
 		 474 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  30.51 
 
 		 379 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  30.25 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  30.25 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  30.29 
 
 		 374 aa  87.4  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 		 424 aa  87  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.16 
 
 		 394 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  28 
 
 		 409 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.04 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  28.71 
 
 		 419 aa  86.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  28.18 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.39 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  29.76 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  26.7 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  29.76 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  30.89 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  38.8 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.16 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  29.87 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  27.59 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  27.6 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  29.74 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  31.31 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.87 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  38.67 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.31 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  28.92 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  29.07 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  38.12 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  33.19 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  38.12 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.96 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  28.93 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  31.82 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  27.99 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.86 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  31.49 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  30.45 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  29.04 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  27.78 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  29.04 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  28.62 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  29.84 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  28.17 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  31.21 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  27.64 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  29.67 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.19 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  29.84 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.37 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  29.84 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  29.5 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  29.18 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.1 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.88 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  32.42 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.08 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  29.17 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  34.78 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.28 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  34.63 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  31.17 
 
 		 511 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  28.67 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  28.99 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  34.52 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  29.51 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  30.65 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  32.34 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2158  2-alkenal reductase  32.34 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  31.36 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  33.77 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  29.53 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  30.77 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.72 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  28.44 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  27.38 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>