More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0366 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  54.45 
 
 
278 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2226  citrate lyase beta subunit  50.92 
 
 
290 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709952  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3029  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  50.55 
 
 
290 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1261  putative citrate lyase  50.55 
 
 
290 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  51.07 
 
 
277 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  48.24 
 
 
283 aa  196  2e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 
277 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  40.85 
 
 
290 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.13 
 
 
294 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  40.98 
 
 
269 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  38.64 
 
 
293 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  43.23 
 
 
281 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  40 
 
 
320 aa  162  4e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  36.98 
 
 
323 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  36.33 
 
 
295 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  34.46 
 
 
295 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  37.46 
 
 
324 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1621  HpcH/HpaI aldolase  44.59 
 
 
362 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0115166  decreased coverage  1.58082e-08 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  39.55 
 
 
274 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  37.06 
 
 
310 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  37.63 
 
 
291 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  37.12 
 
 
323 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  37.63 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  35.26 
 
 
324 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  35.97 
 
 
287 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  37.45 
 
 
270 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  35.26 
 
 
324 aa  156  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  35.26 
 
 
324 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  35.97 
 
 
292 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  41.91 
 
 
277 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  40.52 
 
 
275 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  38.87 
 
 
285 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  37.99 
 
 
278 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  37.55 
 
 
306 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  36.04 
 
 
292 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  39.07 
 
 
313 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  39.77 
 
 
302 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  37.94 
 
 
274 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  40.36 
 
 
279 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  38.32 
 
 
271 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  36.73 
 
 
282 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  40.43 
 
 
292 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  35.97 
 
 
318 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  40.78 
 
 
292 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  39.86 
 
 
288 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  35.95 
 
 
325 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  42.62 
 
 
304 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  39.07 
 
 
286 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  35.62 
 
 
320 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  34.77 
 
 
282 aa  148  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  40.07 
 
 
316 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  36.4 
 
 
284 aa  147  1e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  36.3 
 
 
296 aa  148  1e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.73 
 
 
280 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  35.71 
 
 
275 aa  147  2e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.73 
 
 
280 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.73 
 
 
280 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.73 
 
 
280 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  35.71 
 
 
325 aa  147  2e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.99 
 
 
285 aa  147  2e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  35.67 
 
 
318 aa  146  4e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  35.67 
 
 
318 aa  146  4e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35.67 
 
 
379 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  35.95 
 
 
325 aa  145  8e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  37.46 
 
 
285 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7154  HpcH/HpaI aldolase  36.64 
 
 
291 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  37.46 
 
 
285 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.54 
 
 
284 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  38.18 
 
 
289 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  38.18 
 
 
289 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  35.9 
 
 
318 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  35.76 
 
 
283 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  34.97 
 
 
327 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 
330 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  34.49 
 
 
304 aa  141  1e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.98 
 
 
291 aa  141  1e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  38.65 
 
 
302 aa  141  1e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  38.65 
 
 
305 aa  141  1e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 
293 aa  140  2e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  39.56 
 
 
276 aa  141  2e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
291 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  32.16 
 
 
292 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.62 
 
 
308 aa  139  4e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  38.97 
 
 
287 aa  139  4e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
294 aa  139  5e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  40.23 
 
 
270 aa  139  5e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  37.74 
 
 
270 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  39.71 
 
 
288 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  34.9 
 
 
341 aa  138  8e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  37.28 
 
 
303 aa  138  8e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.63 
 
 
289 aa  138  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.63 
 
 
289 aa  138  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  41.42 
 
 
277 aa  138  9e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.63 
 
 
289 aa  138  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.63 
 
 
289 aa  138  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  35.64 
 
 
290 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  42.11 
 
 
276 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  32.98 
 
 
293 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  36.75 
 
 
292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>