53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0338 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
207 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  44.14 
 
 
267 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  42.86 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  43.38 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  46.1 
 
 
195 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  35.22 
 
 
218 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  40.29 
 
 
270 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  43.61 
 
 
263 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  39.55 
 
 
215 aa  101  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  32.06 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  33.33 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  34.39 
 
 
350 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  30.77 
 
 
268 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.87 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  30.95 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  28.49 
 
 
354 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.33 
 
 
249 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  26.42 
 
 
262 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  29.55 
 
 
293 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  29.37 
 
 
291 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  34.09 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  29.67 
 
 
412 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  26.17 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  33.33 
 
 
384 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  27.06 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  33.57 
 
 
521 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  31.71 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.37 
 
 
307 aa  45.8  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  25.95 
 
 
305 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  34.29 
 
 
556 aa  45.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  30.08 
 
 
292 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  30.86 
 
 
323 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  29.11 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  27.21 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  31.74 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  30.43 
 
 
324 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  27.21 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  27.21 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  29.03 
 
 
377 aa  42.7  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  27.01 
 
 
291 aa  42  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  27.97 
 
 
292 aa  42  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.21 
 
 
210 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  26.81 
 
 
225 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  27.41 
 
 
210 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  28.67 
 
 
377 aa  42  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.5 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  29.77 
 
 
236 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  24.17 
 
 
248 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>