More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0306 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  100 
 
 
556 aa  1115    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.84 
 
 
530 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  44.17 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  43.15 
 
 
529 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  42.96 
 
 
529 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  42.96 
 
 
529 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  43.15 
 
 
529 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  42.96 
 
 
529 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  43.79 
 
 
529 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  43.15 
 
 
529 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  42.59 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  43.52 
 
 
529 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  43.15 
 
 
529 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  42.78 
 
 
529 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  43.15 
 
 
529 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  42.96 
 
 
529 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  43.15 
 
 
529 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.51 
 
 
529 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  42.96 
 
 
529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  42.96 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  42.96 
 
 
529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.78 
 
 
529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.89 
 
 
722 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.8 
 
 
567 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.65 
 
 
509 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  42.7 
 
 
558 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  40.55 
 
 
580 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  42.29 
 
 
560 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.68 
 
 
557 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.26 
 
 
567 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.93 
 
 
604 aa  369  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  41.47 
 
 
555 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  41.11 
 
 
580 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  42.45 
 
 
585 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  40.15 
 
 
607 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  41.57 
 
 
559 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  34.88 
 
 
575 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  35.59 
 
 
574 aa  350  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.96 
 
 
561 aa  341  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  39.2 
 
 
655 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.11 
 
 
571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.11 
 
 
578 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  40.38 
 
 
569 aa  326  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  36.7 
 
 
578 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  39.34 
 
 
611 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  36.51 
 
 
575 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  36.95 
 
 
588 aa  312  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  37.68 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  38.52 
 
 
597 aa  302  8.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  36.64 
 
 
581 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.6 
 
 
560 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  33.77 
 
 
602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  34.52 
 
 
560 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  35.17 
 
 
504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  34.41 
 
 
752 aa  256  7e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  32.68 
 
 
571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.25 
 
 
1284 aa  246  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  35.28 
 
 
583 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  31.61 
 
 
690 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  33.83 
 
 
1181 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.61 
 
 
508 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  32.98 
 
 
1175 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  32.7 
 
 
1215 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  32.57 
 
 
1202 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  30.84 
 
 
765 aa  224  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.81 
 
 
731 aa  220  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  31.03 
 
 
533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  33.45 
 
 
1506 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  31 
 
 
659 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  31.02 
 
 
1512 aa  204  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  30.25 
 
 
657 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.77 
 
 
517 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.72 
 
 
1525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  31.91 
 
 
583 aa  193  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  31.41 
 
 
518 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  29.42 
 
 
638 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.19 
 
 
1577 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.88 
 
 
518 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  31.21 
 
 
518 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.21 
 
 
518 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  31.21 
 
 
518 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.56 
 
 
627 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.14 
 
 
872 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.29 
 
 
586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.21 
 
 
587 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  31.83 
 
 
870 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  30.25 
 
 
520 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.27 
 
 
503 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.71 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  29.66 
 
 
558 aa  181  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.47 
 
 
533 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.34 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.31 
 
 
515 aa  179  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.5 
 
 
539 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  31.25 
 
 
1652 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  30.69 
 
 
663 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  30.06 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.95 
 
 
523 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  28.64 
 
 
1311 aa  173  9e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.76 
 
 
523 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>