63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0269 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0269  CRISPR-associated Csh2 family protein  100 
 
 		 314 aa  634    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2426  CRISPR-associated protein, Csh2 family  68.87 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0614729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0938  CRISPR-associated Csh2 family protein  47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2325  CRISPR-associated Csh2 family protein  47.02 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2663  CRISPR-associated protein, Csh2 family  46.58 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0973  CRISPR-associated protein, Csh2 family  46.18 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15240  CRISPR-associated protein, Csh2 family  42.43 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.105097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3202  CRISPR-associated Csh2 family protein  38.49 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0770  CRISPR-associated Csh2 family protein  40 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1072  CRISPR-associated Csh2 family protein  41.09 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.618984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1184  CRISPR-associated protein, Csh2 family  37.41 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0306  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.32 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1453  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.46 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4290  CRISPR-associated protein, CT1132 family  34.51 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0639  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.8 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2834  CRISPR-associated protein, Csh2 family  38.52 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0623  CRISPR-associated protein, Csh2 family  34.14 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3331  CRISPR-associated protein, Csh2 family  33.77 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1019  CRISPR-associated Csh2 family protein  34.04 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2520  hypothetical protein  29.08 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0537  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.43 
 
 		 329 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1881  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.25 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.576122  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1292  CRISPR-associated protein, Csh2 family  31.29 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1420  CRISPR-associated protein, Csh2 family  30.95 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0231  CRISPR-associated Csh2 family protein  26 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.748958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1486  Csd2 family CRISPR-associated protein  28.11 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3938  CRISPR-associated protein, CT1132 family  27.56 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1067  CRISPR-associated Csh2 family protein  29.72 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0472036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1298  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.94 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.841348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02698  crispr-associated protein, Csd2 family  27.86 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0823  CRISPR-associated protein, Csd2 family  32.27 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3382  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr1 family  28.33 
 
 		 327 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.860383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0831  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.22 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1158  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.91 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0604  CRISPR-associated Csh2 family protein  31.16 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.520474  normal  0.472142 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2975  CRISPR-associated Csd2 family protein  28.97 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0236  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.39 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31600  CRISPR-associated protein Csd2  27.08 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1938  CRISPR-associated Csh2 family protein  30 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.364907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1480  CRISPR-associated protein, Csd2 family  31.74 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3344  CRISPR-associated Csh2 family protein  32.02 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00748339  normal  0.380655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1631  CRISPR-associated protein, Csd2 family  30.19 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.835293  normal  0.948126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0478  hypothetical protein  25.56 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0654  CRISPR-associated Csh2 family protein  33.02 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0495  CRISPR-associated Csh2 family protein  28.77 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3522  CRISPR-associated Csd2 family protein  31.47 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1005  CRISPR-associated Csd2 family protein  30.92 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3579  Csd2 family CRISPR-associated protein  29.73 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1976  CRISPR-associated protein, Csd2 family  29.33 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.856064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1433  CRISPR-associated Csd2 family protein  24.17 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.562068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1726  CRISPR-associated Csd2 family protein  29.73 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0795  CRISPR-associated protein TM1801  27.06 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1974  CRISPR-associated protein, Csd2 family  27.47 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0847  hypothetical protein  24.7 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3648  CRISPR-associated protein, Csd2 family  23.53 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4332  CRISPR-associated Csd2 family protein  24.4 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000155089  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1007  CRISPR-associated Csh2 family protein  26.48 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0353  hypothetical protein  24.03 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.171823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1123  hypothetical protein  24.62 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.011418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1660  CRISPR-associated protein, Csd2 family  50 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3904  CRISPR-associated Csh2 family protein  25.11 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.264914  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2185  CRISPR-associated protein TM1801  25.6 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0661  hypothetical protein  29.94 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.61032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>