More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0232 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
457 aa  851    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.7 
 
 
702 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
521 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.67 
 
 
676 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  50.33 
 
 
215 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  42.39 
 
 
208 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  29.69 
 
 
681 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.07 
 
 
668 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  42.94 
 
 
213 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  48.28 
 
 
245 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  32.57 
 
 
200 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  44.38 
 
 
205 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  47.59 
 
 
199 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  32.57 
 
 
212 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  43.66 
 
 
199 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  44.38 
 
 
215 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  41.05 
 
 
213 aa  113  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  29.51 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  48.2 
 
 
206 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  42.37 
 
 
355 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  39.46 
 
 
214 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  38.59 
 
 
227 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  37.79 
 
 
209 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  37.43 
 
 
200 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  45.58 
 
 
172 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  36.51 
 
 
220 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  38.99 
 
 
202 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.27 
 
 
671 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  44.22 
 
 
197 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  37.18 
 
 
229 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  44.22 
 
 
172 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.86 
 
 
211 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  39.62 
 
 
212 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1183  DedA family protein  31.67 
 
 
677 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  39.62 
 
 
212 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  38.61 
 
 
219 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  45.66 
 
 
200 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  41.08 
 
 
217 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.9 
 
 
205 aa  103  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.31 
 
 
217 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.33 
 
 
209 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  29.89 
 
 
202 aa  99.4  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  40.98 
 
 
218 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  38 
 
 
209 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.8 
 
 
662 aa  98.2  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.99 
 
 
201 aa  98.2  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
202 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  28.98 
 
 
203 aa  97.8  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  27.43 
 
 
195 aa  97.8  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  30.48 
 
 
224 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  34.24 
 
 
202 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  40.23 
 
 
224 aa  96.3  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1470  secretion system protein Y  27.55 
 
 
678 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  33.54 
 
 
210 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  36.65 
 
 
237 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02300  PAP2 superfamily protein  27.55 
 
 
695 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 
202 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  28.26 
 
 
678 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  38.17 
 
 
220 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  36.54 
 
 
217 aa  94  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 
216 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  38.33 
 
 
197 aa  93.2  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  36.54 
 
 
235 aa  93.2  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  36.11 
 
 
218 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  31.25 
 
 
199 aa  92.8  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  39.07 
 
 
202 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  29.83 
 
 
208 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  29.07 
 
 
202 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  35.81 
 
 
204 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  33.33 
 
 
198 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2420  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.27 
 
 
483 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3105  hypothetical protein  30.3 
 
 
686 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  35.81 
 
 
214 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  35.95 
 
 
202 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  34.62 
 
 
279 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.52 
 
 
664 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  37.84 
 
 
222 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  38.26 
 
 
222 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  35.64 
 
 
221 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.48 
 
 
201 aa  91.3  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  36.91 
 
 
226 aa  91.3  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  33.5 
 
 
268 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  40 
 
 
198 aa  91.3  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  30.9 
 
 
208 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  27.42 
 
 
682 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  33.15 
 
 
363 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 
246 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  36.36 
 
 
206 aa  90.1  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  38.41 
 
 
223 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 
203 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 
217 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  42.96 
 
 
213 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
209 aa  89  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.62 
 
 
203 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 
237 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  29.65 
 
 
198 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  36.56 
 
 
202 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>