More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0225 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  60.61 
 
 		 568 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  100 
 
 		 571 aa  1117    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  55.71 
 
 		 574 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  66.55 
 
 		 568 aa  753    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  41.49 
 
 		 593 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  38.74 
 
 		 576 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.93 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  38.56 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  38.8 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  38.63 
 
 		 581 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  43.83 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 630 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  41.29 
 
 		 557 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 627 aa  350  6e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  39.88 
 
 		 497 aa  350  6e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  41.78 
 
 		 510 aa  346  7e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1989  ABC transporter ATP-binding protein  33.75 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0915836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 		 566 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.72 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 		 566 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  32.9 
 
 		 566 aa  336  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  32.97 
 
 		 566 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  34.41 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  38.94 
 
 		 582 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  39.16 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  40.31 
 
 		 478 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 579 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  31.12 
 
 		 566 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  38.33 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  32.97 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 568 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  39.21 
 
 		 574 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  36.41 
 
 		 581 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 571 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.73 
 
 		 568 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2765  ABC transporter related  32.38 
 
 		 570 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2708  ABC transporter related  32.38 
 
 		 570 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.11 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  37.46 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  36.45 
 
 		 501 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  33.52 
 
 		 564 aa  296  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  36.72 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.84 
 
 		 562 aa  294  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 		 558 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.62 
 
 		 590 aa  293  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  34.99 
 
 		 531 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  35.84 
 
 		 481 aa  287  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 530 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  32.5 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0368  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.97 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2045  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.777914  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1973  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.88 
 
 		 558 aa  273  6e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  33.79 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.25 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  35.76 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.34 
 
 		 495 aa  267  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  35.05 
 
 		 810 aa  267  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  35.56 
 
 		 547 aa  264  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3650  ABC transporter related  36.8 
 
 		 517 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.1 
 
 		 770 aa  260  6e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  34.38 
 
 		 526 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  34.12 
 
 		 458 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  34.13 
 
 		 512 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  30.78 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3865  ABC transporter related  36.91 
 
 		 539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1598  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 		 502 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  32.82 
 
 		 540 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  33.33 
 
 		 641 aa  246  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0331  ABC transporter related  35.18 
 
 		 497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  34.45 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.77 
 
 		 550 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  35.4 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0379  ABC transporter related  33.14 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  30.86 
 
 		 490 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  32.37 
 
 		 483 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3337  ABC transporter, ATP-binding protein  30.02 
 
 		 551 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  33.97 
 
 		 543 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  45.53 
 
 		 282 aa  236  8e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  30.22 
 
 		 628 aa  232  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  30.84 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.86 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3317  ABC transporter, ATP-binding protein  30.39 
 
 		 551 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3799  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 581 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0782729  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  28.07 
 
 		 489 aa  227  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0334  ABC transporter related  33.02 
 
 		 495 aa  227  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  30.12 
 
 		 491 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3105  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.21 
 
 		 551 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3364  ABC transporter ATP-binding protein  29.83 
 
 		 551 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.499953  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  33.52 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3118  ABC transporter ATP-binding protein  29.83 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1412  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3100  ABC transporter related  32.23 
 
 		 477 aa  223  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503576  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3323  ABC transporter, ATP-binding protein  29.89 
 
 		 553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>