291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0173 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 309 aa  587  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  35.17 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  31.09 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  36.27 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  35.62 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  35.62 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  34.59 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.92 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.92 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.92 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.55 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  31.86 
 
 		 369 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.82 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.75 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.67 
 
 		 293 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.68 
 
 		 361 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  32.34 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  34.18 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  34.58 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  27.41 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.96 
 
 		 386 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  34.26 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.67 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  33.56 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  32.34 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.82 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.76 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  27.97 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.46 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  33.9 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  34.52 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.21 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.64 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.13 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  30.39 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.24 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  31.07 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.68 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3306  folate-binding protein YgfZ  30.41 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  28.08 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.63 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.11 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.65 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  32.17 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.64 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  33.21 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.95 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  27.72 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.46 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  22.15 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  29.69 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  27.06 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.09 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.54 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.94 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  28.25 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.05 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3840  putative global regulator  27.67 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.891151 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0875  putative global regulator  27.67 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.96 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03546  aminomethyltransferase  30.45 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  35.14 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  35.14 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0691  folate-binding protein YgfZ  33.75 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  25.5 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0872  putative global regulator  27.33 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3962  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.58 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.812707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3431  folate-binding protein YgfZ  27.81 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0089  glycine cleavage T protein(aminomethyl transferase)  24.71 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  30.92 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  32.79 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  31.58 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  31.34 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002488  glycine cleavage T-protein  27.73 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.923355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  32.42 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2049  hypothetical protein  27.98 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  31.29 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0630  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.13 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.31258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02730  putative global regulator  29.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.302082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0794  folate-binding protein YgfZ  29.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1423  hypothetical protein  30.8 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02693  hypothetical protein  29.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.345451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3057  putative global regulator  29.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  31.36 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0318  aminomethyl transferase family protein  28.09 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.23 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4388  folate-binding protein YgfZ  31.27 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410002  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1063  hypothetical protein  31.1 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3031  putative global regulator  30.19 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3225  putative global regulator  29.59 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4228  hypothetical protein  30.33 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  29.5 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  30.64 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1330  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.68 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  28.13 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  28.52 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>