More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0141 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  58.55 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  54.36 
 
 
203 aa  231  7.000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  54.08 
 
 
199 aa  229  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  56.93 
 
 
204 aa  229  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  51.78 
 
 
201 aa  206  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  51.55 
 
 
201 aa  199  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  52.33 
 
 
201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  55.37 
 
 
201 aa  182  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  44.68 
 
 
190 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  38.25 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  38.12 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  34.91 
 
 
180 aa  118  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  36.65 
 
 
176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  33.92 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  34.12 
 
 
193 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  33 
 
 
248 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  37.75 
 
 
188 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
244 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 
185 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  39.35 
 
 
188 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  37.35 
 
 
190 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.85 
 
 
231 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.85 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
176 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.85 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  31.94 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.85 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.35 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.32 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  38.31 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  32.1 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.84 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  30.83 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  33.12 
 
 
174 aa  89  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.81 
 
 
231 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 
248 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.12 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  32.61 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.82 
 
 
239 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
239 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
192 aa  86.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  32.35 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
225 aa  84.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.9 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  25 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.43 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  30.18 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  30.53 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  32.85 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  25.57 
 
 
179 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  29.31 
 
 
533 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  24.43 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  24.43 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  37.5 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  24.43 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  24.43 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  24.43 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.88 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  31.89 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  25 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  32.97 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  34.19 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  29.86 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  27.83 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>