109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0119 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
147 aa  300  6e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  62.33 
 
 
212 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  53.74 
 
 
237 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.68 
 
 
244 aa  154  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4922  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.7 
 
 
295 aa  154  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
240 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
240 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.62 
 
 
240 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  48.63 
 
 
200 aa  154  5e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5184  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.94 
 
 
232 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.26 
 
 
241 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.15 
 
 
222 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.15 
 
 
222 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.15 
 
 
222 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.3 
 
 
251 aa  145  2e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4709  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.63 
 
 
240 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13140  hypothetical protein  50.69 
 
 
262 aa  137  5e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1563  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.61 
 
 
234 aa  136  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  46.48 
 
 
289 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4318  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.63 
 
 
225 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.531167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.55 
 
 
469 aa  132  1e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.33 
 
 
254 aa  132  2e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3967  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.54 
 
 
246 aa  129  2e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5312  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.15 
 
 
232 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.26 
 
 
225 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4106  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  41.5 
 
 
208 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.875742  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.46 
 
 
198 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.46 
 
 
185 aa  113  9e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  42.36 
 
 
306 aa  110  8e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.5 
 
 
241 aa  107  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.13 
 
 
237 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3792  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding:carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.23 
 
 
390 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4285  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.23 
 
 
405 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  31.39 
 
 
208 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  26.53 
 
 
1027 aa  82.8  1e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  29.93 
 
 
206 aa  81.3  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2945  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.62 
 
 
182 aa  79.3  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0435616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.45 
 
 
182 aa  79  2e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3140  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 
182 aa  77.8  4e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0169757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4550  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.08 
 
 
227 aa  73.6  8e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1056  hypothetical protein  31.25 
 
 
241 aa  68.9  2e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184946  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.71 
 
 
147 aa  67.8  4e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5697  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  33.33 
 
 
400 aa  67.8  5e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
157 aa  67.4  7e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.08 
 
 
152 aa  65.1  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.69 
 
 
243 aa  63.2  1e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.52 
 
 
216 aa  62.8  1e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5832  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.88 
 
 
399 aa  61.2  4e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.86 
 
 
156 aa  60.8  6e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 
197 aa  59.7  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.47 
 
 
254 aa  59.7  1e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
241 aa  58.9  2e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  26.9 
 
 
148 aa  58.2  3e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 
155 aa  58.5  3e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.86 
 
 
154 aa  57.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
202 aa  57  9e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.63 
 
 
193 aa  56.2  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.81 
 
 
178 aa  56.2  1e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.05 
 
 
154 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0646  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.25 
 
 
405 aa  55.8  2e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.37 
 
 
158 aa  55.1  3e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.37 
 
 
158 aa  55.1  3e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.86 
 
 
182 aa  55.1  3e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  26.57 
 
 
232 aa  54.7  4e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.57 
 
 
204 aa  54.3  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 
213 aa  54.3  5e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.87 
 
 
151 aa  54.3  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.67 
 
 
176 aa  53.9  7e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
249 aa  53.9  8e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.43 
 
 
153 aa  53.9  8e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  28.78 
 
 
150 aa  53.5  9e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  27.14 
 
 
161 aa  53.5  9e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.38 
 
 
154 aa  53.5  9e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.29 
 
 
141 aa  53.5  9e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  28.78 
 
 
150 aa  53.5  9e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.17 
 
 
176 aa  53.1  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.71 
 
 
151 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.6 
 
 
187 aa  52.8  2e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.14 
 
 
155 aa  52.8  2e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 
152 aa  52.8  2e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.21 
 
 
148 aa  52  3e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.28 
 
 
158 aa  52  3e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.46 
 
 
151 aa  52  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.17 
 
 
198 aa  50.8  6e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  27.97 
 
 
997 aa  50.4  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  27.66 
 
 
213 aa  49.7  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.18 
 
 
151 aa  47.4  7e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  19.05 
 
 
139 aa  47  9e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.27 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  30.39 
 
 
221 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  30.5 
 
 
176 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.27 
 
 
987 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  24.29 
 
 
983 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.57 
 
 
988 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4415  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.57 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.33 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.61 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>