61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0101 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  100 
 
 
325 aa  625  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  45.94 
 
 
326 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  44.1 
 
 
336 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  32 
 
 
286 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  35.42 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  36.14 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  40.12 
 
 
281 aa  86.7  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  32.01 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  29.8 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  33.51 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  30.04 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  36.84 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  30.8 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  31.12 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  35.22 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  43.24 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  32.72 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  31.29 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  29.52 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  36.22 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  28.63 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  28.9 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  28.51 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  29.66 
 
 
292 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  30.49 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  30.47 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  30.15 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  41.44 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  33 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  30.13 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  29.66 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  37.67 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  33.77 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  29.31 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  27.12 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  28.63 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  25.48 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  30.58 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  30.58 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  30.58 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  30.58 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  30.83 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  30.58 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4169  Abortive infection protein  29.17 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.123405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  29.31 
 
 
233 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  30.1 
 
 
433 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  25.65 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  24.38 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  35.29 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1639  Abortive infection protein  26.37 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.153184 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  29.94 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  28.02 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1274  abortive infection protein  25.4 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  30.41 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  32.74 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3149  Abortive infection protein  25.88 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  32.48 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  30.17 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4783  abortive infection protein  21.6 
 
 
317 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.745673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0674  abortive infection protein  26.59 
 
 
277 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.988034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>