35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0100 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  922    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  36.27 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  37.66 
 
 		 526 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.58 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  25.9 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  28.4 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 906 aa  63.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  24.21 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  24.74 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  29.46 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  27.82 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  24.74 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.63 
 
 		 379 aa  60.1  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1935  hypothetical protein  33.09 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1095  NLP/P60 protein  29.51 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00180307  hitchhiker  0.0000000000000270751 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1075  hypothetical protein  26.19 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.855575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.31 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.81 
 
 		 397 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  18.67 
 
 		 432 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  19.11 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13270  hypothetical protein  22.54 
 
 		 389 aa  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.99 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  24.26 
 
 		 398 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  21.5 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.4 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  22.78 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  29.5 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  25.15 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  23.43 
 
 		 360 aa  47  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  24.54 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06750  hypothetical protein  24.56 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19600  hypothetical protein  24.56 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.652812  hitchhiker  0.00117043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.46 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04880  hypothetical protein  24.39 
 
 		 360 aa  43.5  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.34 
 
 		 404 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>