More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0096 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 260 aa  494  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  51.7 
 
 		 269 aa  245  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 268 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 268 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 265 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  46.01 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  46.01 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  46.01 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  48.47 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  46.01 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  45.63 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 269 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  48.08 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  46.18 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  49.81 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 267 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 270 aa  225  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  43.73 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  48.66 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  45.8 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  48.09 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  46.39 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  44.49 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  43.35 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  43.73 
 
 		 271 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 271 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  46.59 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  47.33 
 
 		 273 aa  218  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 273 aa  218  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  43.73 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  44.05 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  47.41 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  43.18 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  46.77 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  44.87 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  46.18 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 276 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  47.91 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  46.21 
 
 		 267 aa  214  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  49.24 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  49.05 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  45.08 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>