More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0095 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 262 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  44.13 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 287 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  38.73 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  43.26 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 277 aa  204  8e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  46.38 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  39.5 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  48.4 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.35 
 
 		 304 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 295 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 287 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  39.44 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 288 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 290 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  41.32 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  39.01 
 
 		 272 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  41.1 
 
 		 289 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  40.75 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  40.75 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  40.75 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  40.75 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  40.75 
 
 		 289 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  36.91 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 279 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  40.64 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0859  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 276 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  41.42 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  39.51 
 
 		 292 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  39.35 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 355 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  41.76 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  40.7 
 
 		 368 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  40.07 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>