More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0089 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  100 
 
 
307 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  46.82 
 
 
300 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  50.33 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 
306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  50.33 
 
 
304 aa  261  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  46.78 
 
 
303 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  44.9 
 
 
293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  44.22 
 
 
293 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
313 aa  239  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  39.46 
 
 
293 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  41.33 
 
 
307 aa  235  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 
297 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
297 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
390 aa  232  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
297 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
297 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
297 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
297 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
297 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
297 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  38.26 
 
 
297 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  42.54 
 
 
339 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  39.13 
 
 
297 aa  228  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  41.16 
 
 
305 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
297 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  39.67 
 
 
302 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  44.67 
 
 
307 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  44.67 
 
 
307 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  41 
 
 
298 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  44.33 
 
 
307 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  42.28 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
308 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  44.56 
 
 
304 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  35.03 
 
 
291 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
314 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  42.24 
 
 
340 aa  215  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  42.86 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  41.52 
 
 
306 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.75 
 
 
317 aa  208  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  41.55 
 
 
309 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  39.53 
 
 
299 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  40.07 
 
 
311 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.86 
 
 
337 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  40.65 
 
 
306 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 
307 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.33 
 
 
312 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.57 
 
 
302 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  42.28 
 
 
316 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
309 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
300 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  41 
 
 
305 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  40.46 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  41.48 
 
 
346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
295 aa  199  5e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
310 aa  198  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  39.14 
 
 
301 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  38.59 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  38.59 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  38.59 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  40.6 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  41.39 
 
 
308 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.87 
 
 
324 aa  195  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  38.51 
 
 
298 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  40.86 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
305 aa  195  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  38.98 
 
 
300 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
305 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  34.47 
 
 
286 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  42.38 
 
 
303 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  41.72 
 
 
318 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  31.29 
 
 
290 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
310 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  37.29 
 
 
302 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  42.18 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
309 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  37.15 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.07 
 
 
302 aa  188  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
310 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  39.14 
 
 
300 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
308 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  40.39 
 
 
309 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
297 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  38.74 
 
 
317 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 
321 aa  185  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
304 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.25 
 
 
316 aa  185  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  38.8 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.21 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.13 
 
 
305 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  36.15 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.94 
 
 
329 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  41.53 
 
 
316 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  46.64 
 
 
332 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  44.14 
 
 
320 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  44.14 
 
 
320 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>