More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0069 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 432 aa  877    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 		 432 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 		 432 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  30.13 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  30.71 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.74 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 411 aa  96.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 411 aa  96.3  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25.34 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.79 
 
 		 439 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 436 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 447 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.75 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.75 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.58 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.11 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.29 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.08 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.96 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 724 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1807  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.14 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.18 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  21.31 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>