More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0060 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  46.5 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  46.67 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  44.97 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1510  ABC transporter related  44.94 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.326694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  41.06 
 
 		 325 aa  208  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  40 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  44.44 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 241 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 242 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 248 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  39.2 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 		 411 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  38.74 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  37.5 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  42.54 
 
 		 512 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  39.14 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  36.98 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 222 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  43.38 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  34.92 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.18 
 
 		 580 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 580 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  41.53 
 
 		 582 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  40.52 
 
 		 579 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 1171 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  38.41 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.49 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  42.86 
 
 		 590 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  42.67 
 
 		 585 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  33.33 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  41.38 
 
 		 583 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  44.8 
 
 		 582 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 585 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  42.67 
 
 		 581 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  42.86 
 
 		 590 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.43 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  33.87 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  42.67 
 
 		 576 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.74 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 576 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  43.72 
 
 		 575 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  45.83 
 
 		 510 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  46.05 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.09 
 
 		 578 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 578 aa  182  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  40.09 
 
 		 578 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  45.41 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  40.09 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  34.53 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  37.06 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  41.56 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  48.17 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  42.17 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 578 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  44.59 
 
 		 593 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  42.17 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 589 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  35.78 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  39.64 
 
 		 580 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  44.25 
 
 		 588 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  42.17 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  40.89 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  39.66 
 
 		 580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  42.24 
 
 		 580 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  41.74 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.54 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  41.74 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  43.18 
 
 		 912 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  36.1 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  41.74 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  42.06 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  41.01 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  38.1 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  43.18 
 
 		 912 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  44.5 
 
 		 917 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  41.74 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>