64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0052 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  100 
 
 
356 aa  689    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  31.94 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  33.15 
 
 
378 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  31.03 
 
 
373 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  26.22 
 
 
370 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  25.16 
 
 
440 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  24.05 
 
 
445 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  32.04 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  28.51 
 
 
457 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  31.82 
 
 
458 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  24.36 
 
 
456 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  24.61 
 
 
456 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  24.29 
 
 
456 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  29.08 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  25.81 
 
 
445 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.01 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.19 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  23.9 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.72 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  33.14 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  26.76 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  28.97 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  28.66 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.24 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.55 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  28.17 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.7 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  26.56 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  28.35 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  29.02 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25.93 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.04 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  27.18 
 
 
313 aa  62.8  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  27.46 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  27.46 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.09 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.15 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  27.46 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  27.43 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  26.29 
 
 
313 aa  60.5  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  28.2 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.58 
 
 
313 aa  59.7  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  28.47 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.15 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  30.51 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  26.3 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  28.08 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  29.86 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  27.5 
 
 
376 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  28.87 
 
 
571 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  29.59 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  27.48 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  28.8 
 
 
313 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.65 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  28.72 
 
 
313 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.37 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  26.45 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  26.63 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.54 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  24.47 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  26.42 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  27.32 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3907  hypothetical protein  23.85 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  0.332979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  23.88 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>