More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0047 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  34.68 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  34.35 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  29.59 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5720  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5341  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5430  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  35.26 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6059  transcriptional regulator, MerR family  31.96 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4880  transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  48.68 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  53.42 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1862  transcriptional regulator, MerR family  45.37 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0767866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4873  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686737  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8430  putative transcriptional regulator, MerR family  58.21 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  30.58 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 136 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09690  predicted transcriptional regulator  49.47 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  0.878429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4382  regulatory protein, MerR  56.52 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 141 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  37.74 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  32.52 
 
 		 132 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  32.52 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8874  transcriptional regulator, MerR family  43.88 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  38.32 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  31.17 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  33.87 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3346  transcriptional regulator, MerR family  42.72 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  37.37 
 
 		 143 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 132 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  36.64 
 
 		 135 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  41.58 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0374  MerR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2417  putative transcriptional regulator, MerR family  51.56 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  40.28 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2015  putative transcriptional regulator, MerR family  51.39 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  44.55 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3862  precorrin-8X methylmutase  44.58 
 
 		 368 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.34 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 134 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 134 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.52 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 630 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 659 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2048  transcriptional regulator, MerR family  52.11 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 630 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4282  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  52.31 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  26.45 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  35.92 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  31.54 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36.43 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>