42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0032 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0032  DoxX  100 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  46.53 
 
 		 188 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  41.96 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  37.84 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  37.91 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  42.57 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  40 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  39.17 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  40.98 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0381  DoxX family protein  40.37 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0203292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  38.79 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1011  DoxX family protein  40.28 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108746  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  45.38 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  39.13 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1121  DoxX family protein  39.87 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  39.13 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07800  DoxX protein  36.73 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  40 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2872  DoxX family protein  39.01 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1514  DoxX family protein  34.96 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0337781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1685  DoxX family protein  45.99 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0178876  normal  0.0868297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1167  hypothetical protein  39.29 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2885  DoxX family protein  44.92 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  32 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1173  hypothetical protein  45.16 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.744688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1059  DoxX family protein  33.06 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0275169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3172  DoxX family protein  37.06 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  34.88 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0556  DoxX family protein  35.51 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0622  hypothetical protein  33.06 
 
 		 430 aa  48.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.566314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  31.06 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1676  DoxX family protein  36.36 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13498  hypothetical protein  27.42 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3499  DoxX family protein  29.13 
 
 		 373 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0805  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0902  hypothetical protein  28.79 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2785  hypothetical protein  28.92 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0310206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0380  DoxX family protein  30.16 
 
 		 360 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0835  hypothetical protein  28.03 
 
 		 297 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000250053  unclonable  0.0000201328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5464  DoxX family protein  26.67 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000243236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  27.94 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  31.18 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>