More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0016 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  500  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
272 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
258 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
296 aa  158  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
260 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
260 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
334 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
332 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
252 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
248 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
339 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
261 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
253 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.55 
 
 
317 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
260 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  43.68 
 
 
301 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 
260 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
258 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  39.9 
 
 
261 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
336 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  39.9 
 
 
261 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 
258 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.77 
 
 
264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
299 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
277 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
250 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
301 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
245 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  38.57 
 
 
260 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.59 
 
 
264 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.59 
 
 
264 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 
262 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.59 
 
 
264 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
248 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  33.59 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.59 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 
270 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.358068  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.59 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
336 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.38 
 
 
264 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 
258 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
264 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
336 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.38 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
238 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
239 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.91 
 
 
230 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 
264 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
264 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2951  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 
276 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  36.68 
 
 
257 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 
247 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  38.81 
 
 
258 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
248 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
258 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 
248 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  37.33 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  39.91 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
337 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  40.69 
 
 
1270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  37.34 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
341 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
264 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
332 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
305 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
339 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.97 
 
 
235 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
281 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.26 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
254 aa  131  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
272 aa  131  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
254 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>