63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0015 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  100 
 
 
80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  68.92 
 
 
175 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  48.05 
 
 
231 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  46.67 
 
 
590 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  43.59 
 
 
261 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  42.67 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  45.95 
 
 
274 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  46.67 
 
 
254 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  43.24 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  42.86 
 
 
258 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  47.89 
 
 
255 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  50.72 
 
 
237 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  43.24 
 
 
238 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  38.96 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  39.74 
 
 
241 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  42.67 
 
 
177 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  38.89 
 
 
269 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  41.89 
 
 
316 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  38.96 
 
 
635 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  39.19 
 
 
310 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2630  hypothetical protein  47.95 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 
262 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  39.19 
 
 
327 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  43.06 
 
 
272 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  41.67 
 
 
272 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  38.16 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  41.67 
 
 
340 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  40.28 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  37.5 
 
 
285 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  37.14 
 
 
247 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  24.77 
 
 
224 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 
293 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  38.16 
 
 
266 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  32.47 
 
 
286 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  41.33 
 
 
200 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1771  RDD domain-containing protein  37.66 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  32.88 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1856  RDD domain containing protein  41.43 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  38.16 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  46.38 
 
 
235 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3141  RDD  39.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  39.13 
 
 
241 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  33.33 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  35.21 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  40.28 
 
 
343 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  35.9 
 
 
288 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  36.84 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  38.96 
 
 
270 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  39.19 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  40.58 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  44.93 
 
 
241 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  40.58 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  36.11 
 
 
269 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  36.26 
 
 
279 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  36.84 
 
 
268 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1595  RDD domain containing protein  39.73 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  36.99 
 
 
229 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  33.78 
 
 
198 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  31.58 
 
 
159 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  44.23 
 
 
247 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>