230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4101 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  84.42 
 
 		 82 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  82.05 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  81.58 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  80.26 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  77.78 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  80.26 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  59.21 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  59.21 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  59.21 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  57.89 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  76.32 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  76.32 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  76.32 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  76.32 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  76.32 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  76.32 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  65.28 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  72.73 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  57.89 
 
 		 93 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  57.89 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  61.9 
 
 		 93 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  59.74 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  61.84 
 
 		 94 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  63.33 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  57.89 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1052  F0F1 ATP synthase subunit C  82.54 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  56.94 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1124  F0F1 ATP synthase subunit C  80.26 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  54.05 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  54.05 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  54.05 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  54.05 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  52.11 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  64.91 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  52.94 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  52.11 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  49.3 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  47.89 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  47.89 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  47.22 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  46.48 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  46.48 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  46.48 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  46.58 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.44 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  57.63 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  58.18 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  55.93 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  57.89 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  51.79 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  53.12 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  58.49 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  51.79 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  44.16 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  54.39 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  56.14 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  44.16 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  45.07 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  53.85 
 
 		 90 aa  62  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  50 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  45.9 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  58.7 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  47.22 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  47.22 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  47.22 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  48.15 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  50.98 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>