121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4060 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  100 
 
 
218 aa  414  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  97.56 
 
 
205 aa  317  8e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  81.59 
 
 
220 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  49.07 
 
 
243 aa  183  2e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  44.39 
 
 
232 aa  173  2e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  47.69 
 
 
236 aa  171  6e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.77 
 
 
247 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  47.91 
 
 
247 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  44.44 
 
 
241 aa  157  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  42.99 
 
 
243 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  42.06 
 
 
243 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  40.85 
 
 
243 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  43.54 
 
 
247 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  45.41 
 
 
227 aa  144  8e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  42.99 
 
 
261 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  39.72 
 
 
243 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  46.05 
 
 
258 aa  141  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  42.72 
 
 
243 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.33 
 
 
245 aa  137  9e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.52 
 
 
245 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.15 
 
 
245 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  40.69 
 
 
247 aa  130  1e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.47 
 
 
278 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.47 
 
 
245 aa  128  5e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  41.59 
 
 
243 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.93 
 
 
285 aa  128  8e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  40 
 
 
278 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.93 
 
 
288 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  40 
 
 
279 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  40 
 
 
263 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  39.73 
 
 
238 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  40 
 
 
263 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  40 
 
 
263 aa  124  8e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  40 
 
 
263 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  40.47 
 
 
288 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.19 
 
 
244 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.36 
 
 
247 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  38.83 
 
 
234 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.6 
 
 
242 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.53 
 
 
242 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  37.67 
 
 
242 aa  120  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  39.53 
 
 
242 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  39.53 
 
 
242 aa  120  2e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  39.07 
 
 
287 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 
244 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.98 
 
 
253 aa  117  1e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  39.17 
 
 
280 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  37.79 
 
 
247 aa  117  2e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  38.14 
 
 
327 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  39.17 
 
 
280 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  38.14 
 
 
318 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  39.17 
 
 
280 aa  117  2e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  38.14 
 
 
280 aa  117  2e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.38 
 
 
240 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.6 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  38.6 
 
 
240 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  38.6 
 
 
240 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  38.6 
 
 
242 aa  114  9e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  37.79 
 
 
240 aa  114  1e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.25 
 
 
252 aa  112  4e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  38.89 
 
 
258 aa  110  1e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  41.44 
 
 
220 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  41.44 
 
 
220 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  41.44 
 
 
220 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  35.07 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  39.13 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  35.68 
 
 
212 aa  82  7e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 
627 aa  78.2  8e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  35.2 
 
 
250 aa  74.3  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.8 
 
 
256 aa  73.6  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02830  nitrogen metabolism-related protein, putative  32.1 
 
 
276 aa  73.2  3e-12  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0852649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  30.29 
 
 
279 aa  73.2  3e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.71 
 
 
241 aa  69.7  3e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  33.33 
 
 
249 aa  69.7  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.82 
 
 
245 aa  68.6  7e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.82 
 
 
245 aa  68.6  7e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  31.52 
 
 
253 aa  67.8  1e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  30.62 
 
 
254 aa  67  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1238  putative racemase  30.92 
 
 
236 aa  65.5  5e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205483  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.32 
 
 
250 aa  65.5  7e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  40.8 
 
 
216 aa  64.3  1e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  30.58 
 
 
248 aa  63.5  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  32.07 
 
 
239 aa  63.5  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  34.43 
 
 
219 aa  62.4  5e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  29.17 
 
 
245 aa  62  7e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.24 
 
 
248 aa  61.6  9e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  28.64 
 
 
245 aa  61.2  1e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.16 
 
 
250 aa  60.1  2e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.86 
 
 
226 aa  59.7  4e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  34.22 
 
 
231 aa  59.7  4e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  30.77 
 
 
213 aa  59.3  4e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  29.76 
 
 
213 aa  58.9  6e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  32.04 
 
 
213 aa  58.5  7e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.18 
 
 
251 aa  58.2  9e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.11 
 
 
239 aa  57.4  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  31.21 
 
 
252 aa  56.6  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.57 
 
 
241 aa  57  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.49 
 
 
250 aa  55.1  8e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  34.59 
 
 
223 aa  53.5  2e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31723  predicted protein  25.11 
 
 
230 aa  53.9  2e-06  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  0.555446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>