173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4023 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  98.75 
 
 
564 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  100 
 
 
561 aa  1073    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  89.55 
 
 
561 aa  805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.97 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  42.02 
 
 
563 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.79 
 
 
548 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  46.15 
 
 
548 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  44.51 
 
 
547 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  43.68 
 
 
565 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  47.44 
 
 
542 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.28 
 
 
576 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  41.8 
 
 
563 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.05 
 
 
556 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.87 
 
 
556 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  41.24 
 
 
577 aa  362  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.04 
 
 
552 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  42.31 
 
 
565 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.93 
 
 
562 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  39.36 
 
 
582 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  39.36 
 
 
582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  39.13 
 
 
552 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.7 
 
 
549 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  41.9 
 
 
561 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  39.17 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.93 
 
 
553 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.94 
 
 
552 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.75 
 
 
552 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.56 
 
 
552 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.49 
 
 
559 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.37 
 
 
552 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  38.85 
 
 
561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  36.02 
 
 
556 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  38.94 
 
 
550 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.04 
 
 
601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  39.78 
 
 
548 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  39.02 
 
 
548 aa  317  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  39.52 
 
 
553 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.68 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  39.13 
 
 
550 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  34.58 
 
 
560 aa  313  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  34.3 
 
 
558 aa  312  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  34.3 
 
 
558 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.07 
 
 
565 aa  311  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  37.59 
 
 
557 aa  310  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.24 
 
 
548 aa  309  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.05 
 
 
548 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.68 
 
 
548 aa  306  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.92 
 
 
543 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  39.59 
 
 
546 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  37.92 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.92 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.92 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.92 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.92 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  37.92 
 
 
543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.92 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  37.92 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  37.92 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  37.92 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  37.92 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  37.92 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  37.92 
 
 
543 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.73 
 
 
570 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.81 
 
 
548 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  38.68 
 
 
568 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.43 
 
 
562 aa  280  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  37.61 
 
 
553 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.99 
 
 
567 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  37.32 
 
 
578 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  35.9 
 
 
548 aa  259  8e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  32.62 
 
 
562 aa  256  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.5 
 
 
566 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000511336  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  32.57 
 
 
535 aa  250  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.22 
 
 
563 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.84 
 
 
556 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000190084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  40.11 
 
 
555 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  27.5 
 
 
537 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  27.69 
 
 
537 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  39.81 
 
 
555 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  31.33 
 
 
558 aa  212  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.64 
 
 
536 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013552  decreased coverage  0.0000000000000784363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1672  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.37 
 
 
565 aa  205  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.38 
 
 
643 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0479  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.92 
 
 
538 aa  192  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  25.65 
 
 
551 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  25.65 
 
 
551 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.65 
 
 
551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000107719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1734  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.42 
 
 
564 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.67 
 
 
541 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
551 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000188119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.67 
 
 
541 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
544 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000242556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
551 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000104541  decreased coverage  0.00000000000000521204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  25.46 
 
 
551 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  25.46 
 
 
551 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000253455  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.48 
 
 
541 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.05 
 
 
541 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1000  Na+/Picotransporter  28.11 
 
 
559 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>