73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3995 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  360  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  93.33 
 
 		 176 aa  284  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  44.77 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  40.22 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  50 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  39.66 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  45.53 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  37.85 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  46.88 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  44.27 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  47.97 
 
 		 156 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  45.22 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  43.55 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  40.77 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  36.14 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  42.74 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  38.71 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  36.63 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  38.71 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  44.55 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  41.94 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  35 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  43.64 
 
 		 160 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  37.08 
 
 		 162 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  37.08 
 
 		 162 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  39.37 
 
 		 272 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  39.52 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  39.55 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  42.74 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  39.84 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  38.21 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  39.69 
 
 		 159 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  37.4 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  39.2 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  33.56 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  33.77 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 154 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  35.1 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  34.44 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  31.61 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  32.6 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.03 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  31.37 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  32 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  30.07 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  33.1 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  28.43 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  30.71 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  26.62 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  25.37 
 
 		 534 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  29.92 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  32 
 
 		 505 aa  52  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  31.48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  32.08 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  34 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.07 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  31.72 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  23.24 
 
 		 314 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  26.92 
 
 		 125 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  25.62 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  30.63 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  29.82 
 
 		 157 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  29.69 
 
 		 143 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1012  hypothetical protein  29.17 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  27.42 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3015  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0676858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>