More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3961 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3961  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3222  ABC ferric siderophore transporter, ATPase subunit  99.21 
 
 
252 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4267  hypothetical protein  76.89 
 
 
252 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1008  ABC transporter related  54.84 
 
 
252 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4399  ABC transporter related  51.98 
 
 
252 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2624  ABC transporter related  53.97 
 
 
252 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0297  ABC transporter related  53.78 
 
 
252 aa  264  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3784  ABC transporter related  52.08 
 
 
253 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2369  ABC transporter related  50.2 
 
 
252 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.068232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2401  ABC transporter related  50.4 
 
 
252 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0997446  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  47.7 
 
 
252 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  48.75 
 
 
252 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
252 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1910  ABC transporter related  47.83 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.115927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0018  ABC transporter-like protein  49.59 
 
 
252 aa  245  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
252 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  48.16 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0658  ABC transporter related  46.99 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5025  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
252 aa  242  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  43.03 
 
 
252 aa  241  9e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0068  ABC transporter related  42.63 
 
 
252 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0361  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 
252 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4147  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 
252 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.045067  normal  0.0104969 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4095  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 
252 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1543  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
251 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0733  ABC transporter related  42.63 
 
 
252 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1114  iron chelate ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1353  enterochelin ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
251 aa  231  6e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25320  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  49.36 
 
 
251 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30510  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  48.28 
 
 
254 aa  231  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  47.01 
 
 
253 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1396  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
252 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471533  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16570  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  46.22 
 
 
251 aa  229  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3705  ABC transporter related  47.81 
 
 
251 aa  228  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252984  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
259 aa  228  8e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1008  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
253 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3341  ABC transporter related  46.44 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3468  ABC transporter related  46.44 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000329  ferric vibriobactin enterobactin transport system ATP-binding protein  40.64 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000365879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0776  ABC transporter related  39.2 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.166423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06132  iron(III) ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0759  ABC transporter related  39.2 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2660  ABC transporter related  42 
 
 
250 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0998  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
254 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000010903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5244  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5231  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4915  ABC transporter related  41.6 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4949  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.957601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4792  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4812  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5327  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.502609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5194  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5223  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1627  ABC transporter related  45.34 
 
 
253 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0010  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3667  ABC transporter related  44.77 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2913  ABC transporter related  46.54 
 
 
250 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000412877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2592  ferric siderophore ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
258 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1929  ABC transporter related  38.65 
 
 
252 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.284313  normal  0.0400988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2666  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
263 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  44.9 
 
 
268 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  45.9 
 
 
284 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0637  ABC transporter related  36.65 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1026  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  42 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0106643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  42.52 
 
 
271 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  43.6 
 
 
269 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
270 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  40.42 
 
 
270 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
270 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
270 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
270 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 
270 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  44.67 
 
 
260 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 
270 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 
270 aa  188  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 
270 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  43.36 
 
 
285 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
274 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  44.69 
 
 
290 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  46.26 
 
 
282 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  44.4 
 
 
255 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  40.64 
 
 
255 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  41.56 
 
 
273 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  43.15 
 
 
265 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
265 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.57 
 
 
271 aa  184  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  42.32 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.32 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  42.23 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
265 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  41.91 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  41.91 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>