More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3916 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  92.47 
 
 		 146 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  70.07 
 
 		 138 aa  212  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  65 
 
 		 174 aa  189  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  59.85 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  51.56 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  50.39 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  55.2 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 		 164 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  52.85 
 
 		 143 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  47.79 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  49.22 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  49.62 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  49.61 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  49.22 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  48.44 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  50.81 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  46.92 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  46.92 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  47.24 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  51.61 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  50.81 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  45.38 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  46.46 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  50.78 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  47.93 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  45.6 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  52.17 
 
 		 208 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  44 
 
 		 195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  44.44 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  43.41 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  46.46 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  46.46 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  41.43 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  41.8 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  39.52 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  47.58 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  33.79 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  44.66 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  38.93 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  39.37 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  34 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36.45 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  33.63 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  29.23 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  33.63 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.19 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  33.63 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  33.63 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  33.63 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  33.63 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  31.3 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  31.3 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.74 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.74 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  29 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  35.14 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  32.35 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  29.52 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.44 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  33.67 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  27.52 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1472  ferric uptake regulator, Fur family  30.43 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  31.19 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  31.71 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0466  ferric uptake regulator family protein  32.74 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000190383  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  28.45 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1143  ferric uptake regulator, Fur family  27.42 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000124537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  35.96 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  33.65 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1799  FUR family manganese uptake regulator  37.93 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1594  ferric uptake regulator, Fur family  27.69 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  25.66 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  27.36 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  35.37 
 
 		 186 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0208  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  26.87 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  32.63 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3947  FUR family manganese uptake regulator  27.18 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960435  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1354  ferric uptake regulator, Fur family  33.71 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000236384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01181  ferric uptake regulator Fur  28.57 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0678895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>