74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3848 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  910  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  98.72 
 
 
469 aa  904  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  62.7 
 
 
455 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  51.95 
 
 
444 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  47.54 
 
 
466 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  41.8 
 
 
445 aa  321  2e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  41.23 
 
 
442 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  35.02 
 
 
455 aa  267  3e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
453 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  39.53 
 
 
474 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  40.65 
 
 
462 aa  245  1e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  38.15 
 
 
465 aa  243  4e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  39.45 
 
 
473 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  34.62 
 
 
471 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.14 
 
 
475 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  34.14 
 
 
467 aa  222  1e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  38.48 
 
 
466 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  38.48 
 
 
466 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  38.48 
 
 
466 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  38.48 
 
 
466 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  38.48 
 
 
466 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  38.26 
 
 
466 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  32.82 
 
 
467 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.36 
 
 
460 aa  217  3e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.88 
 
 
460 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.88 
 
 
460 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  37.37 
 
 
470 aa  216  6e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  32.96 
 
 
471 aa  212  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  33.7 
 
 
456 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  36.13 
 
 
474 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
455 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.83 
 
 
481 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  32.6 
 
 
453 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.76 
 
 
482 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  34.56 
 
 
470 aa  196  8e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
485 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.3 
 
 
443 aa  193  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 
445 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.97 
 
 
468 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 
523 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
480 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.47 
 
 
883 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  32.97 
 
 
473 aa  181  3e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  32.69 
 
 
479 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  32.82 
 
 
464 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  30.8 
 
 
468 aa  173  7e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  29.61 
 
 
466 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  31.25 
 
 
468 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  30.49 
 
 
454 aa  166  1e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  40.36 
 
 
1751 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
478 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  28.57 
 
 
478 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  29 
 
 
499 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.54 
 
 
458 aa  131  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.89 
 
 
506 aa  113  7e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.33 
 
 
490 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  27.73 
 
 
507 aa  68.9  2e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  41.57 
 
 
125 aa  68.6  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
479 aa  62.4  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2673  hypothetical protein  35.77 
 
 
314 aa  61.6  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  25.68 
 
 
633 aa  58.2  3e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  40.62 
 
 
239 aa  57  7e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  32.54 
 
 
477 aa  55.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5301  hypothetical protein  44.93 
 
 
303 aa  55.8  2e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.730903  normal  0.0168693 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  18.38 
 
 
494 aa  52.4  2e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.06 
 
 
536 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  23.14 
 
 
572 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  42.11 
 
 
61 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  26.98 
 
 
534 aa  46.6  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  28.75 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  25.53 
 
 
580 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  28.77 
 
 
534 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.01 
 
 
608 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
419 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>