89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3722 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  64.37 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  56.98 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  55.17 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  55.81 
 
 		 107 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5163  hypothetical protein  51.72 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.934572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  51.72 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  52.87 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  51.72 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  51.72 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1901  hypothetical protein  54.02 
 
 		 106 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00121592  normal  0.870164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  51.72 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  39.08 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4630  protein of unknown function DUF1330  37.93 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3354  hypothetical protein  61.11 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10898  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  43.21 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  42.67 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  37.35 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  35.06 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  35.53 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  32.89 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  35.14 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.21 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  37.14 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  34.57 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  36.23 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  33.82 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  37.65 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  32.89 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  41.1 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  31.58 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  32 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  32 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  38.27 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  29.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  29.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  35.38 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  35.62 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  31.08 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  32.89 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  32.84 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  29.73 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  32.89 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  28.95 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  28.95 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  32.47 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  32.47 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  30.26 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  30.67 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  30.67 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  33.85 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  30.77 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  28 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  32.91 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  30.67 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  34.85 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  31.17 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  26.67 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  35.19 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0358  hypothetical protein  37.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  27.63 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  26.25 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  38.1 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  33.85 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  27.27 
 
 		 104 aa  42  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  32.47 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  32.31 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  26.25 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  29.41 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  34.85 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  27.63 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  28.95 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  27.63 
 
 		 97 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>