216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3720 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 364 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  27.65 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  29.49 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 337 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  34.25 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1410  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  41.05 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  27.85 
 
 		 640 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.52 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.34 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  29.79 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  32.37 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.15 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.3 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  28.65 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.97 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 565 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.68 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.58 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.24 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.22 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.89 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.51 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.51 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.75 
 
 		 347 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.74 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1150  DNA mismatch repair protein  27.82 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.926871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.31 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1690  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 361 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.69 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.89 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1384  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  hitchhiker  0.00082809 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.81 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.88 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  26.86 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.92 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.07 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.01 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.02 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.36 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 1000 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  27.66 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1006  radical SAM family protein  26.47 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.25 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.36 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.89 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.24 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.33 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  22.16 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  22.52 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  22.28 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.21 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.96 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.51 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  30.15 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.91 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.22 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.823795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.22 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.63 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>