More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3693 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
371 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  60 
 
 
381 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  56.62 
 
 
380 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  36.06 
 
 
389 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.27 
 
 
350 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 
365 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
391 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.85 
 
 
360 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
368 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
395 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
412 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
412 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
410 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  31.97 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  30 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
374 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
363 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  41.4 
 
 
739 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  45.45 
 
 
453 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
409 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
353 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  36.88 
 
 
433 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  39.8 
 
 
383 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 
415 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 
366 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  36.36 
 
 
411 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
379 aa  99.4  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  40.36 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.13 
 
 
440 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
382 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
426 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  39.22 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
391 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
377 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0730  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00119132  hitchhiker  0.00102221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  39.89 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.5 
 
 
369 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
395 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
403 aa  93.6  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
350 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
404 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
404 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.39 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
435 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.32 
 
 
423 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  36.93 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  38.82 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  42.28 
 
 
413 aa  89.7  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.27 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
396 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
406 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
487 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
371 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  30.15 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>