More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3687 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
174 aa  348  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  65.19 
 
 
168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  67.3 
 
 
159 aa  215  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  63.64 
 
 
182 aa  214  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  71.33 
 
 
168 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  63.92 
 
 
167 aa  197  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  57.99 
 
 
169 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  66.43 
 
 
166 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  57.86 
 
 
160 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  52.78 
 
 
159 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  49.09 
 
 
175 aa  167  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  48.48 
 
 
175 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.81 
 
 
196 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  46.79 
 
 
182 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  53.49 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  50 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  41.78 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  43.2 
 
 
310 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2423  acetyltransferase  45.64 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  42.95 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1362  hexapaptide repeat-containing transferase  44 
 
 
156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  46.56 
 
 
228 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  46.56 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  44.53 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.98 
 
 
316 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  45.04 
 
 
198 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  37.2 
 
 
317 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  46.56 
 
 
198 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.98 
 
 
192 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  43.08 
 
 
198 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  44.96 
 
 
207 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  44.35 
 
 
182 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  41.22 
 
 
315 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  40.65 
 
 
309 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  44.96 
 
 
182 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  39.06 
 
 
191 aa  101  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.54 
 
 
192 aa  100  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
192 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  44.36 
 
 
517 aa  99.8  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  37.18 
 
 
304 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  46.62 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  38.93 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  43.61 
 
 
517 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  43.54 
 
 
212 aa  98.6  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  40.88 
 
 
313 aa  97.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  40.41 
 
 
254 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.34 
 
 
203 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.36 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  45.04 
 
 
197 aa  95.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.45 
 
 
207 aa  94.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  36.52 
 
 
312 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  44.96 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  40.13 
 
 
203 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  42.86 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.46 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  40.14 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 
207 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  41.04 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  44.27 
 
 
191 aa  91.3  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  40.14 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  39.02 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  37.16 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  37.41 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  39.73 
 
 
254 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  37.41 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  42.11 
 
 
201 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  41.09 
 
 
215 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  43.51 
 
 
190 aa  89  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  37.67 
 
 
191 aa  89  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  42.54 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  38.78 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  36.42 
 
 
192 aa  88.2  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  39.44 
 
 
252 aa  87.8  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  34.39 
 
 
153 aa  87.8  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
236 aa  87.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  37.4 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.89 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  40.85 
 
 
246 aa  85.5  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  35.76 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.42 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  38.71 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  42.42 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.84 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  42.74 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  35.85 
 
 
240 aa  81.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  38 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  38.03 
 
 
251 aa  81.3  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2590  hexapaptide repeat-containing transferase  33.73 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  39.84 
 
 
199 aa  80.9  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.82 
 
 
214 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  34.92 
 
 
240 aa  80.9  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  36.29 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  34.5 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3001  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2872  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.61489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1346  hexapaptide repeat-containing transferase  34.5 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0185286 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2855  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1504  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.92 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272036  normal  0.496738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>