231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3582 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 451 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  46.24 
 
 		 500 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  44.19 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  47.83 
 
 		 462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  35.97 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  42.89 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  35.52 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  35.11 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  35.53 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  40.54 
 
 		 465 aa  210  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  40.29 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  34.88 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  33.03 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 483 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  33.41 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  33.18 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  34.3 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  34.51 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  33.75 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  33.78 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  37.71 
 
 		 456 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  32.84 
 
 		 463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  35.26 
 
 		 454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  37.27 
 
 		 458 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  36.24 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  36.93 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.09 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  33.41 
 
 		 481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  38.25 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.39 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  33.94 
 
 		 471 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  32.2 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  36.97 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  37.2 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  33.9 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  34.4 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  34.25 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  37.95 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  31.42 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  34.78 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.71 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.79 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  37.89 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  34.36 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  34.87 
 
 		 458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  36.22 
 
 		 503 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  36.22 
 
 		 503 aa  146  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  36.22 
 
 		 503 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  36.47 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  36.87 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  36.98 
 
 		 472 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  34.49 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.81 
 
 		 449 aa  143  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  28.6 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.25 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  36.78 
 
 		 458 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  30.79 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.79 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.5 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.53 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.97 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  33.51 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  35.48 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30.43 
 
 		 461 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.7 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.98 
 
 		 458 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  32.24 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.51 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.82 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  32.26 
 
 		 457 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  37.5 
 
 		 447 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  32.38 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.61 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  30.64 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.19 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  29.44 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  31.67 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  31.94 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.71 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  31.39 
 
 		 482 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  33.42 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  25.38 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  30.05 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.09 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  32.42 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.99 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  29.53 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  28.94 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  28.94 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  28.94 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  27.68 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  34.14 
 
 		 456 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>