21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3496 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  98.92 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  87.77 
 
 
278 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  84.89 
 
 
277 aa  487  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  76.62 
 
 
278 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  39.43 
 
 
277 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  38.99 
 
 
395 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  38.63 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  35.96 
 
 
302 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  41.57 
 
 
576 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  41.3 
 
 
595 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  33.1 
 
 
393 aa  87  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  44.44 
 
 
103 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  33.33 
 
 
498 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  32.89 
 
 
237 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  41.33 
 
 
242 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  23.2 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  23.2 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  23.2 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  32 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  31.25 
 
 
226 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>