More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3440 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  98.16 
 
 		 544 aa  1055    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  67.03 
 
 		 544 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  71.78 
 
 		 547 aa  765    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  68.88 
 
 		 543 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  68.21 
 
 		 545 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  68.18 
 
 		 540 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  62.83 
 
 		 538 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  100 
 
 		 544 aa  1077    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  63.23 
 
 		 534 aa  633  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  63.41 
 
 		 534 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  58.3 
 
 		 544 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  52.81 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  51.3 
 
 		 547 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  45.12 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  45.12 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  44.93 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  45.85 
 
 		 545 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  46.85 
 
 		 543 aa  435  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  44.96 
 
 		 526 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  43.23 
 
 		 525 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  43.4 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  42.7 
 
 		 528 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  41.59 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  41.59 
 
 		 542 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  42.97 
 
 		 528 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  40.68 
 
 		 527 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01568  conserved hypothetical protein  39.72 
 
 		 603 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.677654  normal  0.0579254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  39.7 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  40.72 
 
 		 527 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00680  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 621 aa  329  8e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  40.25 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06985  FGGY-family carbohydrate kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04680)  38.15 
 
 		 541 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4175  carbohydrate kinase, FGGY  38.55 
 
 		 480 aa  269  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.929603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  32.1 
 
 		 502 aa  204  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  32.02 
 
 		 497 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  33.6 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  29.49 
 
 		 501 aa  192  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  25.84 
 
 		 503 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  31.56 
 
 		 585 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  28.6 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  28.09 
 
 		 556 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  31.1 
 
 		 577 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  29.7 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  30.3 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  31.31 
 
 		 554 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  25.24 
 
 		 512 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  27.77 
 
 		 562 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  25.05 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  29.61 
 
 		 498 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  28.6 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  27.06 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  31.62 
 
 		 598 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.86 
 
 		 513 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  25.34 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  27.68 
 
 		 564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  32.84 
 
 		 564 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  30.85 
 
 		 556 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  24.67 
 
 		 513 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.47 
 
 		 513 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  24.47 
 
 		 513 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  24.47 
 
 		 513 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.08 
 
 		 508 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  24.47 
 
 		 513 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  24.66 
 
 		 513 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  27.59 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.12 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  31.4 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  31.68 
 
 		 551 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  27.99 
 
 		 512 aa  137  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  31.62 
 
 		 579 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  24.66 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  25.66 
 
 		 518 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  28.14 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.9 
 
 		 511 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  24.19 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  29.48 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0596  sugar (pentulose and hexulose) kinase  26.25 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.354732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  28.44 
 
 		 554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  27.22 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  28.34 
 
 		 564 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  27.48 
 
 		 505 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  22.45 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  24.41 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  23.3 
 
 		 500 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  22.81 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  23.39 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  23.39 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  21.16 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  23.97 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  27.69 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  23.97 
 
 		 512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  29.02 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  24.19 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  26.52 
 
 		 519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.93 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  27.12 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  29.04 
 
 		 544 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  26.82 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  23.55 
 
 		 509 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  25.37 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>